党的十八届三中全会指出：“坚持谁受益、谁补偿原则，
省委十一届四次全会提出：“建立健全生态补偿机制和环境保护管理体制。尽快出台生态补偿机制实施办法，在八大水系和草海实施生态补偿。推动地区间搭建协商平台，建立生态补偿横向转移支付制度。”《贵州省生态文明建设促进条例》要求：省、市(州)人民政府应当按照保护者受益、污染者(破坏者)赔偿、受益者补偿的原则，逐步建立健全生态保护补偿机制。
贵州省完善多元化投入保障和生态保护补偿机制，主要做好三件事：一是积极探索建立健全生态保护补偿体制机制。在清水江、红枫湖、赤水河及乌江实施流域水污染防治生态补偿，颁布了《贵州省清水江流域水污染补偿办法》《贵州省红枫湖水污染防治生态补偿办法》《贵州省赤水河流域水污染防治生态补偿暂行办法》《贵州省乌江流域水污染防治生态补偿办法》。制定了《赤水河流域建立生态环境治理和恢复制度》。印发《关于健全生态保护补偿机制的实施意见》，明确了健全生态保护补偿机制的总体要求和目标，提出在森林、水流、草地、湿地、耕地等五个重点领域加快建立健全生态保护补偿机制，并提出在重点生态功能区、横向生态保护补偿、结合生态补偿推进精准脱贫等七个方面推进体制机制创新。二是积极推进生态补偿试点工作。2009年起，贵州省先期于清水江流域开展生态补偿试点，主要遵循“谁受益谁补偿，谁污染谁付费”的原则，结合省内流域实施情况，逐步在清水江、红枫湖、赤水河、乌江推广实施。三是优化财政资金供给和补偿机制。贵州省已逐步将地方财政森林生态效益补偿标准由每年每亩5元提高至8元，截至2016年底，已累计到位地方公益林补偿资金8.06亿元，有力推动绿色贵州建设。通过优化供给机制和丰富支持措施，财政支持生态文明建设的政策体系不断完善，财政资金的引导、支撑和保障作用进一步发挥。
通过实施多元化投入和生态补偿，主要河流水质得到进一步改善。清水江流域实施生态补偿五年来，黔南州、黔东南州等污染物排放大幅削减，清水江流域水质得到大幅改善。乌江沿河出境断面水体中总磷浓度为0.13mg/L，较2015年同期相比下降了34%。红枫湖流域水质总体良好，常年保持三类水质要求。赤水河流域水质总体良好，所有监测断面均达到规定水质类别，出境鲢鱼溪断面稳定达到二类。
